Mặc dù DNA và RNA thường không xảy ra trong cùng một polynucleotide, bốn loài nucleotide có thể xảy ra theo bất kỳ thứ tự nào trong chuỗi. Trình tự các loài DNA hoặc RNA cho một polynucleotide nhất định là yếu tố chính quyết định chức năng của nó trong một sinh vật sống hoặc một thí nghiệm khoa học.